为了确保蛇毒的利用价值，其质量的优劣至为重要。因此，必须妥善地处理好有关环节，判断蛇毒的质量要求了解蛇毒制备的全过程，并根据其色泽是否纯正，质地是否松脆，或是颗粒的大小和形状等方面初步判断蛇毒的质量优劣。通常判断蛇毒质量须用5个项目，必要时要加一个酶的指标，衡量蛇毒质量要各个项目和指标内在联系，且相互关联反映该蛇毒质量。
(1)电泳各种蛇毒的成分是不同的，在将蛇毒置于聚丙烯酰胺凝胶上时，由于其各组分带电情况不同，它们在电场中的泳动情况亦异，从而各种蛇毒就会显示出自己特殊的电泳区带。据此测可判定真伪或有无混人别的蛇毒。 (2)生物毒力 即小鼠半数致死量(LD。。)。它是将蛇毒配成一定的浓度，注入体重约20克的小鼠体内，能引起50％的小鼠在1天内死亡的干毒量。其单位为毫克／千克。分子中的单位毫克是指干蛇毒用量，分母中的千克是指小鼠体重，均经计算后得出。此值越小表示该种蛇毒的毒力越强。但蛇毒进入小鼠体内的途径不同。值也不同。
(3)蛋白质的含量 蛇毒中蛋白质含量达90％左右，因此测定蛇毒中所含蛋白质的百分率即可，百分率愈高品质愈佳。
(4)测定溶解度 以非溶性物质表示，其值越小，品质越好，一般以O．5％为宜。
(5)蛇毒中的含水量蛇毒虽已经干燥，但在正常情况下仍含有一定量的水分。测定毒液中的含水量是以解毒液重量作分母，以解毒液重减去干毒重的差为分子，得出的百分数。若含水量高，说明蛇毒重量有虚假数值。一般规定，含水量不宜高于5％，以1 9／6～3％为佳。
(6)酶活力 酶是生物催化剂。由于大多数酶较敏感，制备蛇毒过程中极易丧失活力。故有时要求测定蛇毒中含有的酶及其活力大小。酶的种类甚多，一般以单位重量的蛇毒中，某一酶具有的活力单位来表示。
衡量蛇毒质量的各项指标都有内在联系，所以在鉴别蛇毒质量时首先要看电泳一项，确定它是否为该种蛇毒，在此前提下，若LD。。小，即毒力强，说明该毒质量好。而要LDso小一般总以蛋白质含量高、溶解性好、含水量低为综合指标，否则，难以显示其强的毒力。若蛇毒中含水量高，则易使其变质，导致溶解度差、LD。。大、蛋白质浓度低等。此外，蛇毒制备过程中要求精心操作，不能把不同种的蛇毒相混，蛇毒中也不能混有脓液、黏液、微生物、血液和泥沙等。外观上即使未能明显看出，但其质量指标必然有所反映。蛇毒在进入市场前，均需进行以上鉴定，然后定价销售。
