头部有鼻孔和眼各1对。鼻孔开口在吻部两侧，水栖种类(如海蛇、水游蛇等)则开口在吻背面，并且有鼻瓣调节开关，便于呼吸。眼位于鼻孔后方，眼睑不能活动，无瞬膜，上下眼睑愈合成透明膜，覆盖在眼球外面，既能透光，又能保护眼球。蛇蜕皮时，此膜不透明呈烟雾色，暂时失明，蜕皮后复明。蛇的视觉不灵敏，尤其对静止的物体更“视而不见”，只能察觉近距离的活物体。蛇的视力亦因种类不同而有差别,昼行性蛇类的视力较夜行性种类强。蛇没有外耳孔，中耳亦无鼓膜和鼓室，仅有1对耳柱骨与内耳相连，不能感受空气传导的声波，所以蛇类是“聋子”，但对接触地面的物体或树枝的振动很敏感，这就是“打草惊蛇”的道理，也因此它们能预测地震。蝮科蛇类在鼻孔与眼之间有一深凹陷，称为颊窝(见图2-4_4)，能测出周围环境千分之几摄氏度(0.002℃）的温差，颊窝内的膜接触水流时,能测出0.003℃的水温差，是很灵敏的“热测位器”，用以探测捕食对象（如鼠类）的位置，可准确无误地捕捉食物。蛇的鼻不是嗅觉器官，真正的嗅觉器官是位于口腔背壁前方的锄鼻器，它与鼻腔无关，是一种化学感受器(嗅神经末梢分布于其内壁粘膜上），不与外界相通。舌细长，前端分叉，不具味觉功能，基部有舌鞘，伸缩性强，能伸出口外很长，频频伸缩，灵活摆动，用来粘附环境中的化学物质，送入働鼻器以完成嗅觉功能。舌实际是嗅觉辅助器，并没有毒，对人和动物都没有危害。
